西學(xué)東漸，給了儒學(xué)以有力的挑戰(zhàn)和強(qiáng)大的威脅，但也給儒學(xué)輸送了延續(xù)生命的維他命營養(yǎng)。西學(xué)對儒學(xué)影響最大的有以下幾個(gè)方面：
(1)科學(xué)技術(shù)。儒學(xué)重社會(huì)輕自然、重倫理輕技藝的致思趨向，造成了儒學(xué)空疏不實(shí)，自然科學(xué)知識貧乏、膚淺的弊端。當(dāng)西方傳教士將近代西方科技傳入中國時(shí)，一方面受到禮部侍郎沈?、儒士黃貞等保守主義者的批判和攻擊，一方面也受到徐光啟、李之藻等人的熱烈歡迎。鴉片戰(zhàn)爭后，國門洞開，西方文化的浪潮洶涌而入。天文、歷法、地理、數(shù)學(xué)、物理、化學(xué)、生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、火器、建筑、造船、焊接、鍛鐵、機(jī)器織布等各種學(xué)說和技術(shù)傳入中國，不僅填補(bǔ)了中國科技方面的許多空白，而且沖擊了儒學(xué)視工藝技術(shù)為“奇技淫巧”的陳腐之見，給儒學(xué)注入了面向自然、注重實(shí)踐的務(wù)實(shí)精神。
以數(shù)學(xué)語言和實(shí)證手段為特征的西方近代科學(xué)方法，逐漸取代中國傳統(tǒng)的“經(jīng)驗(yàn)型”方法。實(shí)驗(yàn)方法、歸納方法與數(shù)學(xué)演繹方法的使用，推動(dòng)了中國科技由“中古型”向近代方向的發(fā)展。
(2)政治思想。西方的自由、平等、博愛以及天賦人權(quán)、進(jìn)化論等思想以及資產(chǎn)階級的君主立憲、三權(quán)分立的政治制度，在一些憂國憂民的進(jìn)步知識分子中產(chǎn)生了很大的影響，龔自珍、魏源等地主階級革新派提出了“變古”、“更法”的主張，康有為、譚嗣同、梁啟超等以進(jìn)化論為思想武器，大膽批判封建制度和傳統(tǒng)道德，發(fā)出了沖決封建主義羅網(wǎng)的戰(zhàn)斗吶喊，要求改良以致推翻封建制度，廢專制，設(shè)議會(huì)；學(xué)實(shí)業(yè)，致富強(qiáng)；廢八股，辦新學(xué)，形成了一股思想解放的潮流。
(3)哲學(xué)。建立在近代科技基礎(chǔ)上的西方資產(chǎn)階級哲學(xué)，有力地改造了中國傳統(tǒng)哲學(xué)，促進(jìn)了中國近代哲學(xué)的形成和發(fā)展，康有為、譚嗣同等努力學(xué)習(xí)西方的近代自然科學(xué)知識，以康德的星云說、達(dá)爾文的進(jìn)化論、細(xì)胞學(xué)說等新的理論作為哲學(xué)變革的自然科學(xué)基礎(chǔ)，用“以太”、“星云”、“原子”、“細(xì)胞”、“電”、“力”等自然科學(xué)概念改造傳統(tǒng)哲學(xué)范疇，創(chuàng)造了進(jìn)化唯物主義的新型宇宙論和進(jìn)化論的社會(huì)歷史觀。
(4)倫理。以三綱五常為核心的儒家名教，在西學(xué)的沖擊下發(fā)生了蛻變?？涤袨樵谒摹洞笸瑫分兄赋觥叭?，合大地”、“去級界，無有階級”、“去種界，無黃白黑”、“去形界，男女平權(quán)”、“去家界，無家族”、“去業(yè)界，財(cái)產(chǎn)公有”、“去類界，泛愛萬物”等口號，認(rèn)為仁就是“自由”、“平等”、“博愛”,人人平等，沒有家庭，“無家族。男女同棲不得逾一年，屆期須易人”(《清代學(xué)術(shù)概論》)。譚嗣同認(rèn)為，“仁”最根本的特性是“通”,即平等。而“中國君權(quán)太重，父權(quán)太重”(《仁學(xué)》卷上),重男輕女。五倫之中只有朋友一倫是平等的，必須實(shí)行國際交往平等的“中外通”,排除專制的“上下通”、男女平等的“內(nèi)外通”、博愛自由的“人我通”。梁啟超提出，“道德之立，所以利群也”(《新民說·論公德》),利群是以利己為基礎(chǔ)的，公益私意是一非二，所以“利己必先利群”。雖然王先謙、葉德輝、張之洞等極力攻擊維新派，但資產(chǎn)階級的倫理思想已經(jīng)在儒學(xué)營壘中打開了一個(gè)很大的缺口，強(qiáng)烈地撼動(dòng)了封建倫常及其維護(hù)的封建制度。
(5) 文化藝術(shù)。拉丁化拼音被應(yīng)用于中文，并在中國的國際事務(wù)中使用。元代，精通儒學(xué)、法學(xué)、天文、地理、鐘律、算數(shù)、水利以及外國著述的阿拉伯學(xué)者贍恩(1278—1351)著有《西域異人傳》、《西國圖經(jīng)》等許多著作，為儒學(xué)的對外交流作出了貢獻(xiàn)。各種歐洲風(fēng)格的建筑藝術(shù)、西洋繪畫、音樂樂器也進(jìn)入了中國，豐富了古老的中華文化。