蔣介石偕宋氏兄妹在張學(xué)良陪同下于25日下午到達洛陽。蔣在洛陽令張給楊去電，將仍扣留在西安的衛(wèi)立煌、陳誠、蔣鼎文、陳調(diào)元等將領(lǐng)釋放。楊25日深夜接到張的電報，翌日晨經(jīng)與王以哲、周恩來等商議，27日將所有被扣人員釋放，乘機離陜。幾天后又應(yīng)南京方面要求，把扣留的幾十架南京飛機也放走。
12月26日，蔣一回到南京，即命陳布雷杜撰了一篇《對張楊的訓(xùn)詞》在報紙上發(fā)表，把他在西安獲釋說成是由于他“偉大的人格”的感召，回避了他對張、楊做出的承諾。
張學(xué)良到南京一下飛機，即受到軍統(tǒng)特務(wù)和憲兵的監(jiān)視，先被軟禁在宋子文公館。蔣通過宋暗示張應(yīng)有來京待罪的表示，張給蔣寫了一封信，說自己“生性魯莽粗野，而造成此次違犯紀(jì)律，不敬事件之大罪”,表示“愿領(lǐng)受鈞座之責(zé)罰”^[1]。蔣把此信分送國民黨中央和國民政府，并在呈文中要求免去他的“本兼各職，并嚴(yán)加處分”,同時要求給張以“國法軍法”處分，并說：“現(xiàn)該員已親來都門，束身請罪?！?sup>[2]
12月29日，居正主持召開國民黨中央第三十一次常委會議，說蔣在西安被扣期間“持浩然之正氣，昭示偉大之人格，使倡亂者衷誠感動，悔悟自白”,認為蔣“毫無引咎可言”,對其“所請辭職，應(yīng)予懇切慰留，自請?zhí)幏忠还?jié)，應(yīng)毋庸議”^[3]。接著召開國民黨中央政治委員會第三十二次會議，決定將張送交軍事委員會依軍法處理。
12月31日，由李烈鈞擔(dān)任審判長，朱培德、鹿鐘麟擔(dān)任審判官的高等軍法會審對張學(xué)良進行審判。在審判會上，張說他痛恨和反對“攘外必先安內(nèi)”政策。因為他對蔣介石極端信服，先后數(shù)次將自己意見用書面及口頭方式向蔣陳述，均遭到拒絕和痛斥，在“無法表現(xiàn)意見于我們的國人，也無法貢獻于委員長”的情況下，才不得不“用此手段以要求領(lǐng)袖容納我的主張”。張聲明此舉“并無別的要求”,絕不是為了“地盤金錢”,“完全為要求委員長準(zhǔn)許我們作抗日一切的準(zhǔn)備及行動，開放一切抗日言論，團結(jié)抗日一切力量”^[4]。幾年后李烈鈞與人談起這件事時說：“那簡直是演戲，我不過是奉命扮演這幕戲的主角而已！張漢卿光明磊落，對話直率，無所畏懼。張漢卿發(fā)動西安事變，是反對蔣介石獨裁，謀求全國團結(jié)一致抗日，他問心無愧，有什么畏懼呢？當(dāng)審訊張漢卿時，張問我在湖口起義反對袁世凱復(fù)辟稱帝，如果這是正義的行為，那么，西安事變用兵諫的方式諫止蔣介石獨斷獨行，何罪之有，他幾乎把我問倒了。我無可奈何，只得不讓他再講下去?！?sup>[5]張終以“首謀伙黨對于上官為暴行脅迫”罪名被判處“有期徒刑十年，褫奪公權(quán)五年”^[6]。
蔣介石既授意李烈鈞出面“審張”并判了刑，自己又向國民政府呈請將張“應(yīng)得罪刑予以特赦，并責(zé)令戴罪圖動，努力自贖”。^[7]在上海的孔祥熙1月3日也致電國民政府，要求準(zhǔn)蔣所請，對張“準(zhǔn)予赦宥，以示寬大”^[8]。
1月4日，林森主持召開第二十二次國民政府委員會會議，決定對張實行特赦。當(dāng)天發(fā)布命令說：“張學(xué)良所處十年有期徒刑本刑，特予赦免，仍交軍事委員會嚴(yán)加管束。”^[9]這一紙“管束”令，宣告張學(xué)良從此失去了自由，過著被幽禁的生活。