同善堂成立之前，有幾年的籌備階段。在清光緒十四年(一八八八),已由一群熱心慈善事業(yè)的港澳紳商發(fā)起，籌辦了行善團(tuán)體，設(shè)立臨時(shí)辦事處。捐資興辦善舉，包括在高沙(今日之珠海拱北)設(shè)立義冢、并施棺木，醫(yī)時(shí)病、贈(zèng)丸散、講圣諭、派善書及敬執(zhí)字紙等。直到光緒十八年(一八九二)秋，再由一大群紳商名流發(fā)起倡建同善堂，把原有的行善團(tuán)體正式命名為同善堂。同善堂的歷史從這一年正式開始。
為甚么要?jiǎng)?chuàng)辦同善堂？這完全是出于澳門華人社會(huì)的需要。雖然當(dāng)時(shí)的鏡湖醫(yī)院開辦逾二十年，尚未能滿足華人社會(huì)需要。一八九三年十二月九日的中文《鏡海叢報(bào)》頭版的《照譯西論》一文指出，當(dāng)時(shí)的鏡湖醫(yī)院仍未能滿足社會(huì)的需求，“所以澳中善士，又多立一同善堂，以醫(yī)人職此故也”。
同善堂的倡建人四百零八人，皆為熱心人士：多為港澳紳商如梁郁明、鮑啟明、盧九等，還有南海、番禺、順德、新會(huì)、香山、省城以及日本橫濱、美國(guó)檀香山等地的同胞和華僑。可見同善堂的誕生，實(shí)為各界同胞慈善自救的產(chǎn)物。其“同心濟(jì)世”之宗旨維繫迄今，不斷發(fā)揚(yáng)光大。
在一群熱心公益慈善事業(yè)的港澳紳商發(fā)起下，在倡建同善堂之時(shí)，共捐資一萬(wàn)零七十一元零八分，購(gòu)得議事亭前地一幅地段，興建了二層樓宇一座，連裝修耗資四千零一十九元零四分。當(dāng)時(shí)倡建同善堂堂址的共二百六十九人。
同善堂堂址落成，影響頗為深遠(yuǎn)。進(jìn)士出身的太子少保頭品頂戴兵部尚書廉都察院右都御史譚鍾麟，特于光緒二十二年(一八九六)親筆撰寫“倡建蠔鏡同善堂碑序”,以誌紀(jì)念。
而同善堂為隆重其事，在成立之時(shí)，即向政府申請(qǐng)注冊(cè)成立。由“大西洋欽命澳門地捫暨屬地總督”于光緒十九年正月初五日(一八九三年二月廿一日)頒布“倡建濠鏡同善堂總例”。其中的第十九條稱：“本堂乃善士捐資辦善事之地”;第三條稱：“本堂所有善士經(jīng)捐至少五圓(元)為本堂股友”;而倡建時(shí)一共籌得一萬(wàn)零七十一元零八分，可見同善堂是由各階層人士組成，“股友”不少，備受支持。
在一八九三年于政府立案注冊(cè)的章程——《倡建濠鏡同善堂總例》廿四條款中，首、二條款稱：“一、澳門創(chuàng)設(shè)行善公會(huì)名曰同善堂”;“二、本堂原合善士捐資以送時(shí)癥丸散贈(zèng)醫(yī)宣講送書敬執(zhí)字紙等事起見”。因此，倡辦后幾年間，陸續(xù)成立了幾個(gè)善會(huì)展開工作：
一、一八九四年底，成立“保產(chǎn)善會(huì)”,由陳鐸卿、張敬堂、林侶梅、鮑序義等卅二人擔(dān)任值理。該會(huì)之成立，是為助貧苦孕婦分娩以保護(hù)母嬰平安，“因人量施而救產(chǎn)后之危，以輔好生之德”。成立之初的規(guī)條是每位產(chǎn)婦送胎前后丸一個(gè)、生化湯一劑、生姜三斤、白米一斗、白醋五斤、柴五斤、小兒餅食雜用銀一毫、封臍散一包、初生保養(yǎng)藥一劑。
二、一八九五年初，成立“施棺木仵工工善會(huì)”,由麥潤(rùn)齊、繆輝堂等八十九人任值事，捐資得經(jīng)費(fèi)共折銀一萬(wàn)五千零四十元五角八分，捐施棺木備抬工與家貧之苦主。
三、一八九七年，成立“施藥劑善會(huì)”,由林向春、何紹蓉、陳述初等一百八十人為“倡建值事” ,共捐銀七千六百零五元二角五分，由堂中醫(yī)師向貧苦居民贈(zèng)醫(yī)施藥。
四、一八九八年初，成立“赒恤善會(huì)” ,由同善堂勸捐錢銀、棉衣、米粟分派給老弱無(wú)依、貧病交迫者。
五、一八九八年初，成立“中元水陸超幽會(huì)”(幽，指幽魂),規(guī)條訂定：農(nóng)曆“每年七月十五日早在高沙亭啟壇禮懺，是晚放陸幽，即夕雇船放水幽，上至前山，下至媽閣，圍繞一遭，普渡幽魂，同登覺岸?！?br>六、一九二四年秋，倡辦“同善堂貧民義學(xué)” ,附設(shè)在同善堂新址后座，屬書塾式學(xué)堂。祇收數(shù)十名男生，免費(fèi)派發(fā)書簿，使貧民子弟有入學(xué)機(jī)會(huì)。且為匡正人心，每晚在堂內(nèi)講“圣諭”。
一九二五年，復(fù)倡辦“施粥施衣救濟(jì)會(huì)”。
同善堂創(chuàng)辦后的三十余年間，由于陸續(xù)成立了上述善會(huì)，慈善工作日趨完善，不僅施濟(jì)澳門貧民，還經(jīng)常賑濟(jì)內(nèi)地受災(zāi)害者。