1913年7月爆發(fā)的二次革命，總的說(shuō)來(lái)是以孫中山為首的南方國(guó)民黨人發(fā)動(dòng)的；但從爆發(fā)前夕的準(zhǔn)備情況來(lái)看，實(shí)際上是袁世凱有意挑起的，因?yàn)樗缇妥髁宋淞y(tǒng)一的準(zhǔn)備。
經(jīng)過(guò)辛亥革命，北洋各軍戰(zhàn)斗與非戰(zhàn)斗減員十分嚴(yán)重。袁世凱出任臨時(shí)大總統(tǒng)后，立即“密札善后辦法九條”^[1],著手整補(bǔ)各軍。但由于遭到南方的抗議，除雷震春新招八營(yíng)外，其他各軍基本處于停頓，至1912年6月間，缺額狀況仍十分嚴(yán)重。據(jù)當(dāng)時(shí)有關(guān)記載，二鎮(zhèn)只存六千，三鎮(zhèn)四千，四鎮(zhèn)三千^[2]。然而，袁世凱懂得沒(méi)有軍隊(duì)便沒(méi)有他的一切，因此，他一面“敷衍元?jiǎng)住?一面仍“盡全力為秘密軍事上之準(zhǔn)備”^[3]。
1912年8月，袁世凱密令“各軍統(tǒng)制，一律招足十成，不準(zhǔn)缺少一名”^[4]。同時(shí)，他繼續(xù)用封建宗法關(guān)系，加強(qiáng)對(duì)軍隊(duì)的控制?？偨y(tǒng)府軍事參議處傳諭各鎮(zhèn)初級(jí)以上軍官說(shuō)：“北方各軍官源于小站，故袁總統(tǒng)為北軍之父母，今我北方軍訂互約三事，從者簽名，不從者用武力對(duì)付。一、袁總統(tǒng)為北方各軍之父母，無(wú)論何人，有與袁總統(tǒng)反對(duì)者必出死力與之抵抗；二、大總統(tǒng)有統(tǒng)轄海陸軍全權(quán)，凡我軍人，只知有總統(tǒng)，不知其他；三、凡我軍人當(dāng)絕對(duì)的服從總統(tǒng)命令?！?sup>[5]因而北洋各軍就一直在秘密備戰(zhàn)。1912年底，李純的參議李廷玉為出席中央軍事會(huì)議，曾為李純草擬“簡(jiǎn)練勁兵，迅籌軍實(shí)九策”^[6],得到袁世凱和段祺瑞的認(rèn)可。盡管中央財(cái)政拮據(jù)，但袁世凱仍在充實(shí)軍備。據(jù)海關(guān)統(tǒng)計(jì)，天津一口輸入的軍火，1912年為二百七十二萬(wàn)兩，1913年為四百九十萬(wàn)兩。而1913年宋案發(fā)生前的瑞記第三次借款三十萬(wàn)英鎊和陸軍部捷成借款二十八萬(wàn)八千余元，更全部用于訂購(gòu)軍火。
與此同時(shí)，袁世凱還針對(duì)南方作了相應(yīng)的軍事部署。他把第六師(鎮(zhèn)改稱(chēng)師)部署在信陽(yáng)，以師長(zhǎng)李純?nèi)卧ツ湘?zhèn)守使。他支持潰退兗州的張勛所部江防軍，同意張于1912年四五月間擴(kuò)編至一萬(wàn)多人，改稱(chēng)武衛(wèi)前軍，約二十三營(yíng)，超過(guò)一師編制，并不顧南方的強(qiáng)烈抗議，拒絕裁撤張勛所部。他讓辛亥時(shí)招募的武衛(wèi)軍左翼倪嗣沖部屯兵潁州，兵力擴(kuò)至十營(yíng)，于1913年初改編為武衛(wèi)右軍。這三支部隊(duì)，成為袁世凱監(jiān)視南方的第一線(xiàn)部隊(duì)。他又任雷震春為護(hù)軍使，駐兵鄭州；任劉詢(xún)?yōu)橹彪`混成旅旅長(zhǎng)，將建制擴(kuò)充完備，駐廊坊。更為重要的是，袁世凱于1912年四五月間即著手將武衛(wèi)右軍右翼二十五營(yíng)擴(kuò)編為拱衛(wèi)軍，共五路三十營(yíng)，任段芝貴為總司令，分駐北京、彰德兩地。拱衛(wèi)軍的組建，既加強(qiáng)了袁世凱對(duì)軍隊(duì)的控制，又使北洋軍有了一支戰(zhàn)略總預(yù)備隊(duì)性質(zhì)的軍隊(duì)。除上述各部外，袁世凱直接指揮的北洋各軍，第一師(師長(zhǎng)何宗蓮)駐張家口，第二師(師長(zhǎng)王占元)、第三師(師長(zhǎng)曹錕)、第四師(師長(zhǎng)楊善德)駐在京畿、直隸一線(xiàn)，護(hù)衛(wèi)京師，前清禁衛(wèi)軍仍由馮國(guó)璋統(tǒng)率駐于北京，第五師(師長(zhǎng)靳云鵬)駐山東，第二十師(師長(zhǎng)潘矩楹，后為盧永祥)駐奉天新民，中央第二混成旅(旅長(zhǎng)吳慶桐)駐奉天旺官屯。毅軍(軍統(tǒng)姜桂題)主力駐熱河，一部由趙倜統(tǒng)帶駐豫西，另一部交直隸提督馬金敘統(tǒng)帶。而地方上，河南有一師一旅，山東兗州尚有田中玉部巡防營(yíng)等等。以上總兵力，大致相當(dāng)于十五個(gè)建制師，整補(bǔ)后的總兵力當(dāng)超過(guò)十五萬(wàn)人，而整體部署相當(dāng)嚴(yán)密。
1913年3月間，河南都督張鎮(zhèn)芳致函段祺瑞，建議用兵。他說(shuō)：“竊謂刻下大局雖在外患，尤在內(nèi)憂(yōu)。上海歡迎國(guó)會(huì)團(tuán)聞已解散，而意存破壞，可慮者甚多：如遷都也，憲法也，用人之同意也，省長(zhǎng)之民選也，政黨之內(nèi)閣也，地方之分權(quán)也，假公濟(jì)私，爭(zhēng)名奪利，但知運(yùn)動(dòng)，不顧危亡。開(kāi)會(huì)前途，可以逆料，非武力解決，恐不能息此風(fēng)潮?！?sup>[7]段復(fù)函表示：“至于黨派競(jìng)爭(zhēng)，不顧大局，非武力震懾不可，自當(dāng)密為籌備?！?sup>[8]北洋派在宋案發(fā)生以前，就已磨刀霍霍了。
隨著南方反袁情緒的高漲，袁世凱也加強(qiáng)了戰(zhàn)爭(zhēng)準(zhǔn)備，并由此引起了一場(chǎng)意外的內(nèi)部沖突。4月初，參謀部借口蒙事不靖，電令張勛暗中準(zhǔn)備，駐濟(jì)南北洋第五師師長(zhǎng)靳云鵬也奉命下動(dòng)員令，實(shí)際上是要他們做好對(duì)南方用兵的準(zhǔn)備。但參謀部電令不明確，張、靳兩部互不摸底。張勛是個(gè)頑固的復(fù)辟派，企圖據(jù)有山東，擁宣統(tǒng)復(fù)辟。他于4月11日發(fā)餉時(shí)，宣布備戰(zhàn)令，截留津浦車(chē)輛，準(zhǔn)備向南移動(dòng)。時(shí)靳云鵬的第五師也正向韓莊集中，看到張勛行動(dòng)異常，即拆毀鐵軌，截留車(chē)輛，對(duì)張戒備。江蘇第三師得到警報(bào)，根據(jù)蘇督命令，立即作了戰(zhàn)斗準(zhǔn)備，并希望與北洋第五師協(xié)調(diào)行動(dòng)。參謀部看到自相沖突，只好電明解釋誤會(huì)，靳且親至兗州與張會(huì)晤。于是，一幕喜劇性的沖突暫告結(jié)束，各方復(fù)歸原位。
但是，袁世凱并沒(méi)有從此停止備戰(zhàn)活動(dòng)，而且繼續(xù)加緊募兵添械。4月中旬，陸軍部密令上海制造局督理陳榥趕運(yùn)一批槍彈交揚(yáng)州徐寶山，用徐以牽制革命黨人，不久又令陳解步槍子彈六十萬(wàn)顆到京。但程德全害怕給南方革命黨人火上澆油，命令截留緩發(fā)。北京當(dāng)局遂令德州北洋制造局解運(yùn)給徐。善后大借款合同簽訂后，袁世凱得到了帝國(guó)主義的支持，頓時(shí)覺(jué)得膽壯氣粗，開(kāi)始明目張膽地對(duì)南方用兵了。
1913年4月30日，袁世凱在中南海海晏堂召開(kāi)秘密軍事會(huì)議，除部署軍事外，決定采取措施制裁反袁報(bào)紙。翌日，袁命陸軍總長(zhǎng)段祺瑞代理總理，讓因宋案受到輿論攻擊的趙秉鈞稱(chēng)病請(qǐng)假，從而加強(qiáng)了軍事控制，增強(qiáng)了戰(zhàn)爭(zhēng)氣氛。5月3日，袁世凱以西文報(bào)紙報(bào)道的革命黨人備戰(zhàn)消息為由，公然發(fā)布除暴安良令，矛頭直指孫中山、黃興。命令威脅說(shuō)：“總統(tǒng)向稱(chēng)公仆……但使眾望允孚，即能被選，何用藉端發(fā)難，苦我生靈。倘如西報(bào)所言，奸人乘此煽誘，釀成暴動(dòng)，則是擾亂和平，破壞民國(guó)，甘冒天下之不韙。本大總統(tǒng)一日在任，即有捍衛(wèi)疆土、保護(hù)人民之責(zé)，惟有除暴安良，執(zhí)法不貸。”^[9]
5月6日，總統(tǒng)府召開(kāi)第二次秘密軍事會(huì)議，決定了作戰(zhàn)總方略，其中規(guī)定：“有攻擊南方敵軍任務(wù)之北軍，第一期對(duì)于湘、贛、皖、蘇作戰(zhàn)，利用京漢、津浦兩路線(xiàn)集中，以鄂省為主要策源地，并以海軍策應(yīng)沿岸，兼妨害敵軍之集中?！?sup>[10]李純即于5月12日命令步兵第十一混成旅旅長(zhǎng)馬繼增親率二十一團(tuán)開(kāi)往田家鎮(zhèn)，分兵武穴，監(jiān)視九江及安徽方面，命令二十二團(tuán)團(tuán)長(zhǎng)張敬堯開(kāi)往興國(guó)，并親率師部進(jìn)駐蘄春。繼六師之后，北洋第二師也于5月底自保定南下，進(jìn)駐湖北孝感，為六師后援，并彈壓湖北地面。
與此同時(shí)，由于駐上海一帶的海軍艦隊(duì)傾向革命，海軍總長(zhǎng)劉冠雄悄悄派人運(yùn)動(dòng)海軍擁袁。5月中旬，海軍部把這些艦隊(duì)調(diào)赴煙臺(tái)集中檢閱。當(dāng)時(shí)，孫中山主張阻止海軍北上，但黃興、陳其美以為無(wú)礙，未予阻攔。結(jié)果，海軍為袁世凱所收買(mǎi)，改變了政治立場(chǎng)。至此，袁世凱已經(jīng)擺好了決戰(zhàn)的陣勢(shì)。